A nova base de operações é a Vila Yukumo. Este vilarejo tem um toque feudal japonês, desde o design até os residentes. Agora os Felynes treinam na fazenda e têm mais opções de treinamento, como o treinamento para maratona em que o Felyne corre pela fazenda. O jogador pode levar dois Felynes com eles em uma missão para um único jogador, desde o único companheiro de Monster Hunter Freedom Unite. Quando você leva Felynes em missões, os ataques de monstros são divididos entre o jogador e os companheiros, tornando as caçadas mais fáceis. Outra novidade no Monster Hunter Portable 3rdé a capacidade de personalizar o equipamento dos companheiros Felyne. Isso mudará a aparência física e as propriedades da criatura.
O Jogador poderá personalizar o Felynes em três áreas: arma, partes da cabeça e partes do torso. Um novo campo introduzido no jogo é Mountain Stream (渓 流, Keiryū ) . Todos os campos de caça em Monster Hunter Tri , junto com a adição do campo Mountain Stream, estão incluídos no Monster Hunter Portable 3rd .
No entanto, as missões subaquáticas foram completamente removidas, portanto, mapas como a Ilha Deserta e a Floresta Inundada foram revisados para contornar isso. Nem todos os monstros de Monster Hunter Triestão presentes no Monster Hunter Portable 3rd - Lagiacrus, Gobul e Ceadeus foram removidos. Zinogre, o monstro carro-chefe do jogo, é mostrado na capa.