As versões para PS3 e Wii permitem que os fãs joguem como Phineas, Ferb, Perry,
Agent T, Second Dimension Phineas e Second Dimension Ferb como os personagens principais enquanto destravam Isabella, Baljeet, Peter the Panda e Pinky the Chihuahua ao coletar ingressos de minijogos.
Os Jogadores terão a opção de trabalhar juntos em modos cooperativos de dois jogadores enquanto navegam por um antigo mundo de desenho animado no estilo de 1928, uma terra de gnomo de gramado, um mundo de balão e um mundo de gelatina. Em uma missão para salvar o mundo, os jogadores irão viajar por 25 níveis enquanto superam obstáculos. Eles também podem atualizar novos dispositivos, incluindo o Carbonator, que dispara refrigerante de laranja carbonatado que pode derreter os inimigos, e as Luvas Ninja, que permitem aos jogadores grudar nas paredes.
A versão para PlayStation 3 é a primeira vez que um videogame Phineas and Ferb apresentaJogabilidade compatível com o controle de movimento PlayStation Move.