O Jogador controla Ratchet na maioria das vezes, com algumas seções usando Clank, enquanto exploram vários mundos para completar missões, usando a chave de Ratchet e outras armas exóticas obtidas durante o curso do jogo. Às vezes, Ratchet pode entrar em queda livre ou, com uma atualização para Clank, poderá voar; durante esses períodos, o jogador usa a funcionalidade de inclinação do controlador SIXAXIS para manobrar Ratchet. As habilidades de detecção de inclinação do SIXAXIS também são usadas para controlar algumas armas e dispositivos.
